پژوهشکده باغباني با هدف پاسخگويي علمي به نيازهاي توليدات  باغباني استان از سوي بزرگترين قطب علمي آموزش کشاورزي در جنوب شرق ايران  يعني دانشگاه شهيد باهنر کرمان  شکل گرفت  و با توجه به نيازسنجي تحقيقاتي در اين استان ، اين پژوهشکده در سال 1373 با سه گروه پژوهشي (خرما ،مرکبات و گياهان دارويي)  و اخذ موافقت اصولي فعاليت خود را آغاز کرد و در سال 1383 موافقت قطعي دريافت نمود و در ادامه  در سال 1386 نيز گروه مرکبات و خرما به ترتيب به مرکز تحقيقات مرکبات و خرما ارتقاء يافتند و مجوز قطعي آنها صادر گرديد و فعاليتهاي پژوهشي در اين گرهها در حال انجام است.

ضرورت ايجاد پژوهشکده:

استان کرمان به عنوان يکي از پهناورترين استانهاي کشور و در برداشتن طيف متنوع شرايط اقليمي، پتانسيل توليد بسياري از گياهان مختلف و منحصر به فرد را دارد، به طوري که با بيشترين توليدات باغي در کشور نظير پسته، خرما ، مرکبات ، گردو و ... رتبه اول صادرات باغباني کشور را به خود اختصاص داده و از طرفي حضور تنش هاي محيطي مختلف نظير خشکي، شوري ، گرما ، سرما  که هر روز عرصه را بر کشاوزان تنگتر مي­نمايد، بکارگيري شيوه هاي نوين و فنون علمي روز در  کشاورزي و بکارگيري دانش نوين کشاورزي را مي طلبد که پژوهشکده باغباني دانشگاه در راستاي خدمات علمي و تحقيقاتي در اين مسير در حرکت مي­باشد.